真菌基因组中的基因数量，我只有这种细菌的基因组，我怎么知道真菌的种类

在微生物家族中，真菌是最复杂的。 它们种类繁多，数量众多，速度快，分布广泛，与人类有着极其密切的关系。 只能在显微镜下看到的小真菌; 较大的真菌，如灵芝、香菇、木耳等，已经大到大家都能看到。

然而，即使是真菌家族中最小的成员，酵母菌和霉菌，也比细菌和放线菌大几到几十倍。 所以真菌的基因组可大可小，范围也相当大。

迄今为止，已经测序了大约 2,600 个编码酵母中 RNA 或蛋白质的基因。 通过酿酒酵母的全基因组测序，发现在12068 kb的全基因组序列中，有5885个开放阅读框编码特定蛋白质。 这意味着平均而言，酵母基因组中每 2 kb 就有一个编码蛋白质的基因，即整个基因组中的 72 个核苷酸由一个开放的阅读框组成。

这表明酵母基因比其他高等真核生物的基因更紧密地排列。 例如，在**蠕虫的基因组中，平均每 6kb 就有一个编码蛋白质的基因; 在人类基因组中，平均需要 30 kb 或更多才能找到编码蛋白质的基因。 酵母基因组的紧凑性是由于基因的短插层和基因中内含子的稀缺性。

酵母基因组开放阅读框的平均长度为1450 bp或483个密码子，最长的是位于第十二染色体上的功能未知的开放阅读框（4910个密码子），极少数开放阅读框的长度超过1500个密码子。 在酵母基因组中，也有编码短蛋白的基因，例如PMP1基因，它编码由40个氨基酸组成的细胞质膜蛋白脂质。 此外，酵母基因组还包含：

约140个编码RNA的基因，排列在第十二条染色体的长端; 40 个编码 snRNA 的基因，分布在 16 条染色体上; 共有43个家族的275个tRNA基因也广泛分布在基因组中。

总结。 您好，亲爱的，很高兴为您解答！ 为了确定细菌的种类，有必要分析和比较细菌的遗传信息。

一种常见的方法是将细菌的基因组与已知细菌的基因组进行比较，然后确定具有最高相似度的细菌种类。 此外，还可以根据真菌的形态、生理特征、生化特征等推断真菌的种类。 需要注意的是，由于细菌种类繁多，可能无法通过比较基因组来确定物种，需要结合其他信息来做出判断。

我只有这种真菌的基因组，我怎么知道真菌的种类？

亲爱的，很高兴为您微笑！ 为了确定细菌的种类，有必要分析和比较细菌的遗传信息。 一种常见的方法是将细菌的基因组与已知细菌的基因组进行比较，然后确定具有最高相似度的细菌种类。

此外，还可以根据真菌的形态、生理特征和生化特征来推断真菌的种类。 需要注意的是，由于真菌中所含的物种数量众多，有时可能无法通过比较基因组来确定物种，需要结合其他信息来做出判断。

全基因组。

全基因组。

整个基因群是指生物体所有基因的序列信息，包括编码蛋白质的基因和非编码RNA基因。 全基因组测序是一种对基因组进行测序以获得生物体完整基因组序列的技术。 在基因组测序中，可以使用三代高通量测序技术或饥饿训练的其他类型的测序技术获得基因组序列数据，这些技术只能用于基因功能研究、物种进化研究、基因组学研究等。

我丢了那个细菌，只有这个细菌的全基因组，没有办法测量16s，我该怎么办才能知道这个细菌的菌株。

如果你只有一种细菌的全基因组，而没有关于该菌株的其他信息，如形态、生理特征、生化特征等，那么可能很难确定细菌的种类。 但是，可以尝试菌株特异性序列比对，例如 tajima's d'通过值比较和卡尺测序对基因组进行比较，以找到与已知菌株高度相似的序列。 此外，您可以尝试使用一些公共数据库来查找有关这种真菌的信息。

例如，NCBI的Genbank和Ensembl数据库都包含大量的菌株信息，包括粗基因群序列、基因标注信息、分子特征等，可以与菌株的基因组序列进行比较，以确定菌株的种类。

细菌基因组差异很大，基因组大小从几百kb（千个碱基对）到十几mb（兆碱基对）不等，变化超过20倍，以下是几种细菌基因组的大小：

分类基因组大小范围 （kb）。

真细菌 650-13200

革兰氏阴性菌。

革兰氏阳性菌。

兰花菌 3100-13200

支原体 650-1800

古细菌 1600-4100

然而，在我们的实验中，只能提取出大约20-30kb的大小，这可能是DNA太长，容易断裂; 以下文献列出了 12 种真细菌和 4 种古细菌的 16 个完整基因组的大小。