关于如何查找rpoB基因序列的帮助

目的建立一种聚合酶链反应-单链构象多态性（PCR-SSCP）方法检测结核分枝杆菌RPOB基因突变，并评价其临床应用价值。 方法根据结核分枝杆菌RPOB基因的defampicin测定区设计引物，采用PCR扩增临床分离株和直接痰液样本的RPOB基因片段。 对扩增的RPOB基因片段进行DNA SSCP分析，随机测定RPOB片段的序列。 结果PCR扩增212株结核分枝杆菌全部230 bp片段，135份抗酸染色阳性痰标本中113份扩增阳性片段（.

SSCP分析中，140例结核分枝杆菌采用L-J药敏试验，130例采用RPOB基因突变检测（符合率），72例采用LJ药敏试验检测为利福平敏感，67例无RPOB基因突变（符合率。 测序分析显示，SSCP检测到突变的RPOB片段有57个序列变化，SSCP检测到的10个RPOB片段中有8个没有序列变化，表明SSCP与测序结果的吻合率如下。 在这项研究的菌株中，耐多药结核病（MDR-TB）占了比例，SSCP检测到一些具有RPOB突变的耐多药菌株。

结论PCR-SSCP分析法是一种更准确、更稳定的结核分枝杆菌IPOB基因突变检测方法，可用于快速分析结核分枝杆菌对利福平患者的耐药性，可作为耐多药结核病诊断的重要指标。

使用 NCBI 查找基因序列教程。

在NCBI或GeneBank上找到至少10个序列，并使用分子生物学软件对齐它们，就可以找到保守的序列。 当我发现HIV-1的保守序列时，我就是这样做的，引物基本上被扩展了。 尝试。

Clustx 可对齐多种相关蛋白质的序列。 如果要设计简并引物，可以先做块再做跳码，搜索**，就可以**做**。

您可以通过 Google 搜索找到它。

NCBI，如果有序列号，请直接输入。 不，可以通过查找物种和基因名称在 NCBI 中进行搜索。

步骤：1打开。

2.上面有一个搜索栏，默认是pubmed，打开下拉菜单，选择gene，在右侧输入"基因的名称"and"物种名称"，单击搜索。

还有不同物种的专门数据库，如拟南芥（Tair）、水稻（Tigr）和玉米（MaizeSequence）。

在 PubMed 上

基因库，输入你要找的基因名称，最好输入物种缩小范围，这样很多摘要还是会出来的，仔细看看描述，找到你需要的，点击进去，就是全基因组的序列。 我不能告诉你具体细节，你找到一本关于生物信息学的书，里面有一切要谈的，你可以自己好好看看。 推荐大家看一看张成刚和何福初的《生物信息学方法与实践》，虽然是02年编辑的，但我觉得还是不错的，而且不厚，相信看完之后对你的研究工作也会有所帮助。

在NCBI上方找到基因序列的方法如下：首先打开NCBI**主页，然后在搜索栏中选择核苷酸，在框中输入你想要的基因序列名称，点击搜索。 然后会有很多结果，因为很多基因都同名，或者一个基因在不同的物种中不同，只要寻找想要的基因序列就行了。

需要注意的是，要确定基因名称是否统一并找到基因序列，蛋白质序列很容易，因为结果中显示了基因的蛋白质序列。 您可以在搜索开始时选择蛋白质，您找到的就是蛋白质序列。

通常，在顶部字段中输入基因的英文名称。

4.向下滚动以查找序列。

使用 NCBI 查找基因序列教程。

转录本是剪接成高能 RNA 的基因序列过去，据说转录本可以表达蛋白质。 现在关于lncRNA的研究比较多，也说它是一种转录本。

也没有参考基因组序列，一般不可能去功能注解。 因为当你去功能评论时需要有一个背景。

NCBI首页顶部搜索栏左侧有一个数据库选择框，点击下拉三角形选择核苷酸（如图中红色框所示），在搜索栏中输入基因名称进行搜索。 以人类orc1基因为例，在搜索结果中选择mRNA和completecds序列的结果即可，点击进入序列文件查看详情，上图中的搜索结果18就是一个例子，点击界面Lu Shenoak如下，找到cds标签下来， 点击CDS跳出下面这个界面，界面旁边有棕色标记的序列就是cDNA序列，旁边有对应的氨基酸序列。如果搜索结果太多，可以在搜索结果中按物种进行筛选，如下面的红框所示。

这是基本步骤。

我平时在NCBI上找，世界上有三大数据库，NCBI就是其中之一，美国，这个我觉得是最好的。

查找上述基因序列的方法如下：首先打开NCBI**主页，然后在搜索栏中选择核苷酸，在框中输入你想要的基因序列名称，点击搜索。 然后就会有很多结果出来，因为很多基因都有相同的名称，或者一个基因在不同的物种中是不同的，只要寻找你想要的基因序列就行了。

请注意，为了确定你的基因名称是否统一，我曾经花了很多时间寻找一个基因，然后发现我并没有普遍使用它。 找到基因序列，蛋白质序列很容易，因为该基因的蛋白质序列显示在结果中。 您也可以在开始搜索时选择蛋白质，您找到的就是蛋白质序列。

多尝试一下是件好事，其实很简单，如果你的英语很好，那就更简单了。 要有耐心。

只要已经测序的基因是可用的，这就是最完整的基因库。 剩下的就不用想了，如果找不到，只能考虑我上面的经验。